Близьке майбутнє, 2032 рік. Техніка досягла небаченого прогресу. Це світ, який люди розділяють з кіборгами і роботами. Бато - детектив відділу поліції по боротьбі з тероризмом. Він - живий кіборг, оснащений штучними руками, ногами і іншими частинами тіла. Залишився лише його колишній мозок та пам'ять про неї, про Мотоко Кусанагі.

Разом з напарником Тогусою Бато привернутий до розслідування серії вбивств роботами своїх власників, причому всі роботи відносяться до експерементальной моделі секс-андроїдов фірми Locus Solus. Компанія вважала за краще б зам'яти справу, відкликавши роботів з ринку і домовившись з родичами загиблих. Але Бато і Тогуса - не з тих, з ким можна укласти полюбовну угоду.